1- معارج الفهم فی شرح النظم أى نظم البراهین، و النسخة عندنا بخط بعض الأعلام من القدماء.
2- نظم البراهین فی أصول الدین متن المعارج المذکور.
3- الأبحاث المفیدة فی تحصیل العقیدة. قال سیدنا الأمین «قده» فی کتاب أعیان الشیعة: إن علیه شروحا منها شرح المتأله السبزواری.
4- نهایة المرام فی علم الکلام.
5- کشف الفوائد فی شرح قواعد العقائد. طبع.
6- تسلیک النفس إلى حظیرة القدس، و یقال: إنه تحت الطبع.
7- مناهج الیقین أو منهاج الیقین.
8- أنوار الملکوت فی شرح الیاقوت لإبراهیم النوبختی فی الکلام و حدثنی بعض الأفاضل أنّه تحت الطبع على نفقة الکلیّة بطهران.
9- کشف المراد فی شرح تجرید الإعتقاد طبع مرات بالهند و ایران.
10- نهج المسترشدین فی أصول الدّین طبع مرّات.
11- مقصد الواصلین فی معرفة اصول الدّین.
12- منهاج الهدایة و معراج الدرایة.
13- کشف الحق و نهج الصدق الذی صنّفه باستدعاء السلطان المؤید ألجایتو محمّد شاه خدا بنده المغولی، کما صرّح به فی خطبته، و هو الذی ردّ علیه الفضل بن روزبهان و ردّ على الفضل مولانا السیّد السّعید القاضی الشهید فی کتابه إحقاق الحق و ها هو بین یدیک.
14- الهادی فی العقائد.
15- واجب الاعتقاد فی الأصول و الفروع.
16- تحصیل السّداد فی شرح واجب الاعتقاد.
17- منهاج الکرامة الذی صنّفه باسم السلطان المؤید ألجایتو محمّد، و هو الذی ردّ علیه ابن تیمیّة بکتاب سمّاه منهاج السنّة و حرىّ بان یسمّى بمنهاج النوم و السّنة و ردّ علیه مولانا مروّج الشرع الشریف المجاهد الغازی ببنانه و بیانه آیة اللّه السیّد محمّد مهدی القزوینی نزیل بلدة (کویت) و من مشایخنا فی الرّوایة و سمّى کتابه منهج الشریعة جزاه اللّه عن الإسلام خیرا، و حشره مع أجداده الطاهرین و قد طبعت هذه الکتب الثلاثة.
18- کتاب الألفین الفارق بین الصّدق و المین تصدى فیه لذکر ألف دلیل على امامة أمیر المؤمنین علیه السّلام، و ألف دلیل على إبطال شبه المخالفین، و لکنّ الأسف أنّ عمره لم یف بذکر تمام الألفین، بل ذکر الألف الأوّل تماما و لم یذکر من الألف الثانی إلا الیسیر، و طبع مرّات.
19- الرسالة السعدیّة فی الکلام، صنّفها باسم الخواجة سعد الدین السّاوجی وزیر السلطان ألجایتو محمّد، طبعت فی طی مجموعة بطهران.
20- منهاج السّلامة إلى معراج الکرامة.
21- رسالة فی تحقیق معنى الایمان.
22- کتاب إیضاح مخالفة أهل السنّة للکتاب و السنّة.
23- رسالة فی خلق الأعمال.
24- کتاب فی التناسب بین الأشعریة و الفرق السوفسطائیّة.
25- الباب الحادیعشر فی اصول الدّین، ألحقه بمختصر مصباح المتهجد لشیخ الطائفة طبع مرّات، و علیها شروح بألسنة مختلفة.
26- أربعون مسألة فی أصول الدّین.
27- تعلیقة على شرحه على التجرید.
28- استقصاء النظر فی القضاء و القدر صنّفه بالتماس السلطان الجایتو محمّد و طبع بالنجف الأشرف. إلى غیر ذلک من الآثار الخالدة.
