کتبه فی الفلسفة و المنطق

1- القواعد و المقاصد فی المنطق و الطبیعی و الالهی.

2- الأسرار الخفیّة فی العلوم العقلیّة.

3- المقاومات، قال فی الخلاصة: باحثنا فیه الحکماء السابقین و هو یتمّ مع تمام عمرنا.

4- حلّ المشکلات من کتاب التلویحات.

5- إیضاح التلبیس من کلام الشیخ الرّئیس باحث فیه الرئیس ابن سینا.

6- إیضاح المقاصد من حکمة عین القواعد.

7- لبّ الحکمة.

8- إیضاح المعضلات من شرح الإشارات.

9- شرح حکمة الاشراق.

10- نهج العرفان فی علم المیزان فی المنطق.

11- تحریر الأبحاث فی معرفة العلوم الثلاث (المنطق- الطبیعی- الإلهی).

12- کاشف الأستار فی شرح کشف الأسرار.

13- الدّر المکنون فی علم القانون (اى المنطق) 14- مراصد التدقیق و مقاصد التحقیق و رأینا منه نسخة على ظهرها إجازة من المصنّف فی حق الشیخ شمس الدّین الآوى بخطه و قد أثبتنا صورته الفوتوغرافیة، لتکون نموذجا من خطه الشّریف فلیراجع.

15- کشف الخفاء من کتاب الشفاء فی الحکمة لابن سینا.

16- القواعد الجلیّة فی شرح رسالة الشمسیة فی المنطق.

17- الجوهر النضید فی شرح منطق التجرید، و قد طبع.

18- بسط الإشارات فی شرح إشارات ابن سینا.

19- محصل الملخص.

20- الإشارات إلى معانی الإشارات.

21- النور المشرق فی علم المنطق.

22- التعلیم الثانی العام.

23- کشف المشکلات فی کتاب التلویحات، و یظن أنه بعینه حل المشکلات الذی مرّ ذکره.

24- التعلیقة على کتاب أوائل المقالات لمولانا الشیخ المفید. إلى غیر ذلک.