قد عرفت أنّ خالقیّته تعالى عامّة لجمیع الأشیاء و الحوادث، و کلّ ما فی صفحة الوجود یستند إلیه سبحانه، و عندئذ تطرح إشکالات أو شبهات یجب على المتکلم الإجابة عنها، و هی:
أ. شبهة الثنویّة فی خلق الشرور؛
ب. شبهة استناد القبائح إلى اللّه تعالى؛
ج. شبهة الجبر فی الأفعال الإرادیة.
در پرتو عنایت خداوند متعال و توجهات حضرت ولیعصر (عج) و پیرو تاکید مقام معظم رهبری بر تلاش در عرصه نوسازی و اعتلای پژوهش‌های دینی و اسلامی با حداکثر استفاده از روش‌ها و ابزارهای جدید به امر مرجع عالیقدر حضرت آیه الله العظمی مظاهری دامت برکاته در آذرماه سال ۱۳۷۷ تاسیس شده است.
تا کنون گام‌های موثر و چشمگیری در راستای پیشبرد و اعتلای پژوهش‌های اسلامی برداشته که علاوه بر تولید ده‌ها نرم‌افزار دینی، به تحقیق و انتشار کتب مفیدی دست زده است که تاثیر این تحول بنیادی مورد توجه و قبول عالمان، محققان و اندیشمندان جامعه اسلامی قرار گرفته است و تاکنون توانسته رتبه‌های متعددی از جمله خادم قرآن کریم (۱۳۸۴) و خادم فرهنگ عمومی (۱۳۸۶) کسب نماید.
